Некоторые фоновые заболевания печени после ее трансплантации могут проявиться вновь. Вероятность рецидива зависит от особенностей заболевания.

Вирусные гепатиты В и С часто рецидивируют после трансплантации, в то же время гепатит А редко проявляется вновь. Факторы риска рецидивирования гепатита В после рассматриваемого вмешательства включают наличие вирусной HBV ДНК или e-антигена в организме реципиента на момент трансплантации. Недавно долгосрочные режимы профилактики иммуноглобулином гепатита В привели к существенному уменьшению частоты рецидивов. Вирус гепатита С обнаруживается после трансплантации в крови большинства инфицированных пациентов. Однако доля больных, у которых разовьется рецидивирующий цирроз вследствие гепатита С, остается не ясной. Известно, что приблизительно у 15% пациентов повторное проявление ведет к смерти или ретрансплантации в течение первого года после трансплантации. Первичный билиарный цирроз и первичный склерозирующий холангит после трансплантации редко рецидивируют, но аутоиммунный гепатит возникает вновь более чем у половины больных.

Все перечисленные заболевания после трансплантации рецидивируют более стремительно, чем в нативной печени, причем протекают без явной симптоматики. Алкогольная болезнь печени также может снова проявиться после ее пересадки и лучше всего предупреждается тщательным подбором реципиентов. Перед трансплантацией обычно требуется доказанный период воздержания от употребления алкоголя. Фульминантная печеночная недостаточность неясной этиологии после трансплантации редко рецидивирует.